Emiya Shirou é um estudante do colegial que vive na cidade de Fuyuki. Seus pais morreram quando ele tinha cinco anos de idade, depois foi adotado por um homem que se nomeava um mago, que também veio a falecer. O que Shirou não sabe, é que em Fuyuki é palco de uma grande guerra. De dez em dez anos, sete magos de todo mundo se juntam a seus servos - espíritos de heróis, invocados de outra era - e lutam em uma guerra pelo "Cálice Sagrado", uma relíquia que garante grandes poderes ao seu dono. O verdadeiro nome dos seus serventes são sua fraqueza, então eles são chamados apenas pela classe a qual pertence; Archer (Arqueiro), Assassin (Assassino) e etc.